High school student Saya Toma lost her parents and younger brother in an airplane accident. Detective Akio Kondo came and told her "your family has a high possibility that they were killed by people who have spec." That was the first time she heard of "spec". 6 years later, Saya Toma, who has never forgotten what the Detective said, decides to become a detective. She returns to Japan after receiving training by the FBI in the United States. Saya Toma is assigned to work unsolved cases in the Public Security Bureau. Meanwhile, because of Satoshi Chii's scheme, Juichi Ninomae considers Saya Toma his parents' enemy and tries to push her to the edge. Satoshi Chii's scheme has also caused Saya Toma and Juichi Ninomae to forget that they are brother and sister. The siblings are headed to a life-staking fight. A girl named Maho Ueno becomes involved in their fight. To protect Maho Ueno, Saya Toma uses "spec".

经过长时间的休整，治疗眼伤的濑文焚流（加濑亮 饰）终于随着当麻（户田惠梨香 饰）重返阔别已久的未详，只是此时来自公安部公安五课的市柳（でんでん 饰）和吉川（北村一辉 饰）握得实权，令濑文等人颇为气闷。与此同时，在市井算命的觉被一掌握瞬间移动能力的黑衣男子射杀，同时遇害的还有觉的保镖以及几名无辜市民。父母双双遇害而作为幸存者并且目击了黑衣人真实容颜的少女久远望（谷村美月 饰）便成为对方追杀的目标。为了保护小望，未详同仁通力合作，并持续追索黑衣人的真面目以及其背后的阴谋。在此期间，当麻也展示了其不为人知的SPEC。一场斗智斗勇的战斗拉开了序幕……

经过长时间的休整，治疗眼伤的濑文焚流（加濑亮 饰）终于随着当麻（户田惠梨香 饰）重返阔别已久的未详，只是此时来自公安部公安五课的市柳（でんでん 饰）和吉川（北村一辉 饰）握得实权，令濑文等人颇为气闷。与此同时，在市井算命的觉被一掌握瞬间移动能力的黑衣男子射杀，同时遇害的还有觉的保镖以及几名无辜市民。父母双双遇害而作为幸存者并且目击了黑衣人真实容颜的少女久远望（谷村美月 饰）便成为对方追杀的目标。为了保护小望，未详同仁通力合作，并持续追索黑衣人的真面目以及其背后的阴谋。在此期间，当麻也展示了其不为人知的SPEC。一场斗智斗勇的战斗拉开了序幕……

掌控日本国家未来的御前会议上，众要员商议着以猎杀SPEC持有者为目标的“SIMPLE PLAN”，神秘的法蒂玛第三预言亦被提及。数天后，暗中执行猎杀计划的政府成员突然于游艇上全员木乃伊化死亡。案件交由未详系的当麻纱绫（户田惠梨香 饰）和濑文焚流（加濑亮 饰）负责。调查途中两人接到志村美玲（福田沙纪 饰）的求救电话，赶赴救援时与濑文的前同僚兼前恋人青池里子（栗山千明 饰）不期而遇。当麻将美玲带回未详系，原本已经死去的阳太/一十一（神木隆之介 饰）竟从容现身于她们面前。竭力压制着蠢蠢欲动的左手，当麻无力的目睹美玲匆忙留下“一定要阻止法蒂玛第三预言”的信息后被阳太带走。 　　在阳太的恶意煽动下，普通人类与SPEC持有者间的矛盾日益激化。身处两者夹缝之中，当麻对法蒂玛第三预言和人类未来的走向充满了迷惑。玛利亚、白衣教皇、左手持火之剑的天使……预言中的关键人物们若隐若现，黑暗降临的未来是否终将无法避免？

掌控日本国家未来的御前会议上，众要员商议着以猎杀SPEC持有者为目标的“SIMPLE PLAN”，神秘的法蒂玛第三预言亦被提及。数天后，暗中执行猎杀计划的政府成员突然于游艇上全员木乃伊化死亡。案件交由未详系的当麻纱绫（户田惠梨香 饰）和濑文焚流（加濑亮 饰）负责。调查途中两人接到志村美玲（福田沙纪 饰）的求救电话，赶赴救援时与濑文的前同僚兼前恋人青池里子（栗山千明 饰）不期而遇。当麻将美玲带回未详系，原本已经死去的阳太/一十一（神木隆之介 饰）竟从容现身于她们面前。竭力压制着蠢蠢欲动的左手，当麻无力的目睹美玲匆忙留下“一定要阻止法蒂玛第三预言”的信息后被阳太带走。 　　在阳太的恶意煽动下，普通人类与SPEC持有者间的矛盾日益激化。身处两者夹缝之中，当麻对法蒂玛第三预言和人类未来的走向充满了迷惑。玛利亚、白衣教皇、左手持火之剑的天使……预言中的关键人物们若隐若现，黑暗降临的未来是否终将无法避免？

这个世界上，潜藏着一些人，他们身上拥有着超出常人能力和认识范围的特殊能力（spec）。比如拥有更敏锐的感觉，拥有非同寻常的运动神经，拥有极其优秀的天才大脑。　　如果这些人之一将这种能力用于不法途径，如果用特殊能力，觊觎他人的生命和财产以至社会地位，或者，用其窥伺政权……　　同时，这种特殊的能力已经被各国政府所注意，潜藏在水面之下，明争暗斗的潜流已经在不断扩大。

2009年，当麻纱绫（户田惠梨香 饰）和濑文焚流（加濑亮 饰）相识的前一年。在美国FBI学成归来的当麻被分在警视厅公安部公安第五课未详事件特别对策系，接受组长野野村光太郎的直接领导。此前不久，某大型石油企业高管接连被人杀害，死者的心脏无一例外都留下被人用手捏过的痕迹。显而易见，这一系列事件和所谓的SPEC持有者有着极为密切的联系。与此同时，石油企业高管Diablo（大杉涟 饰）高薪聘请神秘SPEC持有者一十一（神木隆之介 饰），企图阻挡神秘的SPEC杀手。一十一，这个日后与当麻和濑文有着不解渊源的难缠敌手将当麻视作杀害父母的爆弹女，之后更斩杀了当麻在美国结识的好友Nancy。SPEC宏大篇章自此拉开序幕，决定世界命运的重大事件也进入了倒计时……

Set one year after the fight between detectives Saya Toma, Takeru Sebumi, and Satoshi Chii. More confrontations ensues between the detectives at the Unidentified Crimes Unit of the Tokyo Metropolitan Police Department. Takeru Sebumi returns after taking a break due to his eye problems. Kenzo Ichiyanagi is appointed section chief, while Kotaro Nonomura is demoted. New member Shu Kikkawa joins the team.

关于“简单计划”（Simple Plan，SP）引起的连锁反应愈演愈烈，野野村组长（龙雷太 饰）舍生取义，现如今世界的命运完全落在当麻纱绫（户田惠梨香 饰）和濑文焚流（加濑亮 饰）这两个生死搭档的肩头上。神秘流感病毒、父亲的好友汤田秀树（远藤宪一 饰）、深藏幕后的J教授，种种线索困扰着当麻，却也渐渐指明了真相所在。        与此同时，场名医师（渡边一计 饰）的身体遭到控制，对正在警察医院受监控的成年SPEC持有者展开无情屠杀，而暂时逃生的少年SPEC持有者也无法避开死亡的命运。弄清了真相却目睹着悲惨一幕的当麻，再也无法抑制被封印的SPEC，任凭灵魂和身体被狂走的能力所挟持。她突然在首脑们的御前会议上出现，与此同时各种灾难相继在各地爆发，法蒂玛第三预言不可避免地实现了。        SPEC持有者的身世缓缓解开，他们和普通人之间的战争全面展开。生存或是毁灭，濑文、当麻以及他们的伙伴，成为左右历史走向的关键人物。这是时代的结局，抑或是新的开始……

左手永远吊着三角巾、头脑异常聪颖缜密的当麻纱绫（户田惠梨香 饰），与凡事靠拳脚说话、性格直率的“行动派”濑文焚流（加濑亮 饰），这两个性格迥异的年轻人作为警视厅公安部公安第五课未详事件特别对策系（简称“未详”）的骨干成员，在与持有“预知未来”、“念力”等SPEC能力的犯罪者的周旋过程中，培养了足以托付生死的信任与默契。        在过去的这些年，地居（城田优 饰）、冷泉（田中哲司 饰）、觉（真野惠里菜 饰）、海野（安田显 饰）等能力各异的SPEC持有者交替登场，而宿命的强敌“一十一”（神木隆之介 饰）无疑是未详的各位同仁以及他们的朋友所遇到过的最可怕且最难缠的敌人。为了歼灭这群“无法无天”的SPEC持有者，政客们秘密制定了“简单计划”（Simple Plan，SP）。与之相对，SPEC持有者相继聚集到一起，形成了牢不可摧的组织。按照法蒂玛第三条预言，“SPEC持有者”与“非持有者”——或者说“相信人类自身可能性的人”和“自我封闭的人”——不同人种间战争即将全面爆发。        经过连番艰苦卓绝的战斗，一十一终于被当麻、濑文他们打败，而濑文也身负重伤住院。在此期间，青池里子（栗山千明 饰）偷偷带着女儿（森山树 饰）离开医院，下落不明。与此同时，某国际会议召开，各国政要商谈继续推进旨在歼灭SPEC持有者的“简单计划”，谁知自称“卑弥呼”的日本代表站出要求立即中止计划，凡是敢于违背他意愿的人均遭到抹杀。另一方面，当麻见到了父亲的好友汤田秀树（远藤宪一 饰），从对方口中她知道克隆人一十一的诞生之谜以及平行世界的些许真相。站在历史的十字路口以及SPEC持有者和普通人类的中间，当麻感到难以排遣的烦恼，她逐渐被自己的SPEC所侵蚀，此时此刻唯有将性命托付给最信赖的搭档濑文。终于在夏威夷与正汽雅（有村架纯 饰）走入婚姻殿堂的野野村组长（龙雷太 饰），则无意间持有了攸关SPEC持有者乃至全人类命运的关键，世界的未来朝向未知的方向疾驰……